superpathway of aromatic amino acid biosynthesis

Metabolites

Cl-

Formula: Cl (34.968853)

CAS ID: 16887-00-6

CO2

Formula: CO2 (43.98983)

CAS ID: 124-38-9

Cobalt ion

Formula: Co (58.933198)

CAS ID: 22541-53-3

Diethyl pyrocarbonate

Formula: C6H10O5 (162.052821)

CAS ID: 1609-47-8

Diphosphate

Formula: H4P2O7 (177.9432294)

CAS ID: 2466-09-3

Fe2+

Formula: Fe (55.934939)

CAS ID: 15438-31-0

H+

Formula: H (1.0078246)

CAS ID: 12408-02-5

H2O

Formula: H2O (18.0105642)

CAS ID: 7732-18-5

Indole

Formula: C8H7N (117.0578462)

CAS ID: 120-72-9

Magnesium cation

Formula: Mg (23.98505)

CAS ID: 22537-22-0

N-Ethylmaleimide

Formula: C6H7NO2 (125.0476762)

CAS ID: 128-53-0

Tetranitromethane

Formula: CN4O8 (195.97161599999998)

CAS ID: 509-14-8

Zinc cation

Formula: Zn (63.929145)

CAS ID: 23713-49-7

Sodium borohydride

Formula: BH4Na (38.0303734)

CAS ID: 16940-66-2

2-oxo-3-phenylpropanoate

Formula: C9H7O3 (163.0395172)

CAS ID: 620-76-8

3-dehydroshikimate

Formula: C7H7O5 (171.02934720000002)

CAS ID:

2-oxoglutarate(2-)

Formula: C5H4O5 (144.00587339999998)

CAS ID: 64-15-3

succinate(2-)

Formula: C4H4O4 (116.01095839999999)

CAS ID: 56-14-4

maleate(2-)

Formula: C4H2O4 (113.99530920000001)

CAS ID: 142-44-9

acetate (ion)

Formula: C2H3O2 (59.0133038)

CAS ID: 71-50-1

3-methyl-2-oxobutanoate

Formula: C5H7O3 (115.0395172)

CAS ID:

pyruvate

Formula: C3H3O3 (87.00821880000001)

CAS ID: 57-60-3

3-(4-hydroxyphenyl)pyruvate

Formula: C9H7O4 (179.0344322)

CAS ID: 622-54-8

3-bromopyruvate

Formula: C3H2BrO3 (164.9187302)

CAS ID: 68-38-2

shikimate

Formula: C7H9O5 (173.0449964)

CAS ID:

3-dehydroquinate

Formula: C7H9O6 (189.0399114)

CAS ID:

anthranilate

Formula: C7H6NO2 (136.0398516)

CAS ID: 9031-59-8

citrate(3-)

Formula: C6H5O7 (189.00352800000002)

CAS ID: 126-44-3

NADPH(4-)

Formula: C21H26N7O17P3 (741.0598016)

CAS ID: 53-57-6

ATP(4-)

Formula: C10H12N5O13P3 (502.9644492)

CAS ID:

NADH(2-)

Formula: C21H27N7O14P2 (663.1091182000001)

CAS ID:

NAD(1-)

Formula: C21H26N7O14P2 (662.1012936000001)

CAS ID: 53-84-9

ADP(3-)

Formula: C10H12N5O10P2 (424.0059412)

CAS ID:

NADP(3-)

Formula: C21H25N7O17P3 (740.051977)

CAS ID: 53-59-8

glyphosate(2-)

Formula: C3H6NO5P (166.9983596)

CAS ID:

pyridoxal 5'-phosphate(2-)

Formula: C8H8NO6P (245.0089238)

CAS ID: 65-23-6

2,4,6-Trinitrobenzene Sulfonate

Formula: C6H2N3O9S- (291.9511782000001)

CAS ID: 16655-63-3

Dithionitrobenzoic acid

Formula: C14H6N2O8S2-2 (393.9565596)

CAS ID:



Enzyme

EC Number name full name note
1.1.1.25 shikimate dehydrogenase (NADP+) shikimate:NADP+ 3-oxidoreductase
1.1.1.282 quinate/shikimate dehydrogenase [NAD(P)+] L-quinate:NAD(P)+ 3-oxidoreductase
1.3.1.12 prephenate dehydrogenase prephenate:NAD+ oxidoreductase (decarboxylating)
2.4.2.18 anthranilate phosphoribosyltransferase N-(5-phospho-D-ribosyl)-anthranilate:diphosphate phospho-alpha-D-ribosyltransferase
2.5.1.19 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase phosphoenolpyruvate:3-phosphoshikimate 5-O-(1-carboxyvinyl)-transferase
2.5.1.54 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase phosphoenolpyruvate:D-erythrose-4-phosphate C-(1-carboxyvinyl)transferase (phosphate-hydrolysing, 2-carboxy-2-oxoethyl-forming)
2.6.1.1 aspartate transaminase L-aspartate:2-oxoglutarate aminotransferase
2.6.1.107 beta-methylphenylalanine transaminase (2S,3S)-3-methylphenylalanine:2-oxoglutarate aminotransferase
2.6.1.42 branched-chain-amino-acid transaminase branched-chain-amino-acid:2-oxoglutarate aminotransferase
2.6.1.57 aromatic-amino-acid transaminase aromatic-amino-acid:2-oxoglutarate aminotransferase
2.7.1.71 shikimate kinase ATP:shikimate 3-phosphotransferase
4.1.1.48 indole-3-glycerol-phosphate synthase 1-(2-carboxyphenylamino)-1-deoxy-D-ribulose-5-phosphate carboxy-lyase [cyclizing; 1-C-(indol-3-yl)glycerol-3-phosphate-forming]
4.1.3.27 anthranilate synthase chorismate pyruvate-lyase (amino-accepting; anthranilate-forming)
4.2.1.10 3-dehydroquinate dehydratase 3-dehydroquinate hydro-lyase (3-dehydroshikimate-forming)
4.2.1.20 tryptophan synthase L-serine hydro-lyase [adding 1-C-(indol-3-yl)glycerol 3-phosphate; L-tryptophan and glyceraldehyde-3-phosphate-forming]
4.2.1.51 prephenate dehydratase prephenate hydro-lyase (decarboxylating; phenylpyruvate-forming)
4.2.3.4 3-dehydroquinate synthase 3-deoxy-D-arabino-hept-2-ulosonate-7-phosphate phosphate-lyase (cyclizing; 3-dehydroquinate-forming)
4.2.3.5 chorismate synthase 5-O-(1-carboxyvinyl)-3-phosphoshikimate phosphate-lyase (chorismate-forming)
5.3.1.24 phosphoribosylanthranilate isomerase N-(5-phospho-beta-D-ribosyl)anthranilate aldose-ketose-isomerase
5.4.99.5 chorismate mutase Chorismate pyruvatemutase


Pathway Source

Organism Taxonomy Group Enzyme List Source Ratio
Escherichia coli K-12 MAGs 1.1.1.25 / 1.1.1.282 / 1.3.1.12 / 2.4.2.18 / 2.5.1.19 / 2.5.1.54 / 2.6.1.1 / 2.6.1.107 / 2.6.1.42 / 2.6.1.57 / 2.7.1.71 / 4.1.1.48 / 4.1.3.27 / 4.2.1.10 / 4.2.1.20 / 4.2.1.51 / 4.2.3.4 / 4.2.3.5 / 5.3.1.24 / 5.4.99.5 100.00%
Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966 MAGs 1.1.1.25 / 1.3.1.12 / 2.4.2.18 / 2.5.1.19 / 2.5.1.54 / 2.6.1.1 / 2.6.1.42 / 2.6.1.57 / 2.7.1.71 / 4.1.1.48 / 4.1.3.27 / 4.2.1.10 / 4.2.1.20 / 4.2.1.51 / 4.2.3.4 / 4.2.3.5 / 5.3.1.24 / 5.4.99.5 90.00%
Knufia peltigerae MAGs 1.1.1.25 / 1.3.1.12 / 2.4.2.18 / 2.5.1.19 / 2.5.1.54 / 2.6.1.1 / 2.6.1.42 / 2.6.1.57 / 2.7.1.71 / 4.1.1.48 / 4.1.3.27 / 4.2.1.10 / 4.2.1.20 / 4.2.1.51 / 4.2.3.4 / 4.2.3.5 / 5.3.1.24 / 5.4.99.5 90.00%
Bacillus cereus ATCC 14579 MAGs 1.1.1.25 / 1.3.1.12 / 2.4.2.18 / 2.5.1.19 / 2.5.1.54 / 2.6.1.1 / 2.6.1.42 / 2.6.1.57 / 2.7.1.71 / 4.1.1.48 / 4.1.3.27 / 4.2.1.10 / 4.2.1.20 / 4.2.1.51 / 4.2.3.4 / 4.2.3.5 / 5.3.1.24 / 5.4.99.5 90.00%
Cupriavidus taiwanensis bacteria 1.1.1.25 / 1.3.1.12 / 2.4.2.18 / 2.5.1.19 / 2.5.1.54 / 2.6.1.1 / 2.6.1.42 / 2.6.1.57 / 2.7.1.71 / 4.1.1.48 / 4.1.3.27 / 4.2.1.10 / 4.2.1.20 / 4.2.1.51 / 4.2.3.4 / 4.2.3.5 / 5.3.1.24 / 5.4.99.5 90.00%
Rhodococcus erythropolis PR4 MAGs 1.1.1.25 / 1.3.1.12 / 2.4.2.18 / 2.5.1.19 / 2.5.1.54 / 2.6.1.1 / 2.6.1.42 / 2.6.1.57 / 2.7.1.71 / 4.1.1.48 / 4.1.3.27 / 4.2.1.10 / 4.2.1.20 / 4.2.1.51 / 4.2.3.4 / 4.2.3.5 / 5.3.1.24 / 5.4.99.5 90.00%
Pseudomonas aeruginosa PAO1 MAGs 1.1.1.25 / 1.3.1.12 / 2.4.2.18 / 2.5.1.19 / 2.5.1.54 / 2.6.1.1 / 2.6.1.42 / 2.6.1.57 / 2.7.1.71 / 4.1.1.48 / 4.1.3.27 / 4.2.1.10 / 4.2.1.20 / 4.2.1.51 / 4.2.3.4 / 4.2.3.5 / 5.3.1.24 / 5.4.99.5 90.00%
Rhodococcus opacus B4 MAGs 1.1.1.25 / 1.3.1.12 / 2.4.2.18 / 2.5.1.19 / 2.5.1.54 / 2.6.1.1 / 2.6.1.42 / 2.6.1.57 / 2.7.1.71 / 4.1.1.48 / 4.1.3.27 / 4.2.1.10 / 4.2.1.20 / 4.2.1.51 / 4.2.3.4 / 4.2.3.5 / 5.3.1.24 / 5.4.99.5 90.00%
Listeria monocytogenes EGD MAGs 1.1.1.25 / 1.1.1.282 / 1.3.1.12 / 2.4.2.18 / 2.5.1.19 / 2.6.1.1 / 2.6.1.42 / 2.6.1.57 / 2.7.1.71 / 4.1.1.48 / 4.1.3.27 / 4.2.1.10 / 4.2.1.20 / 4.2.1.51 / 4.2.3.4 / 4.2.3.5 / 5.3.1.24 / 5.4.99.5 90.00%
Thermus aquaticus Y51MC23 MAGs 1.1.1.25 / 1.3.1.12 / 2.4.2.18 / 2.5.1.19 / 2.5.1.54 / 2.6.1.1 / 2.6.1.42 / 2.6.1.57 / 2.7.1.71 / 4.1.1.48 / 4.1.3.27 / 4.2.1.10 / 4.2.1.20 / 4.2.1.51 / 4.2.3.4 / 4.2.3.5 / 5.3.1.24 / 5.4.99.5 90.00%
Shewanella piezotolerans WP3 MAGs 1.1.1.25 / 1.3.1.12 / 2.4.2.18 / 2.5.1.19 / 2.5.1.54 / 2.6.1.1 / 2.6.1.42 / 2.6.1.57 / 2.7.1.71 / 4.1.1.48 / 4.1.3.27 / 4.2.1.10 / 4.2.1.20 / 4.2.1.51 / 4.2.3.4 / 4.2.3.5 / 5.3.1.24 / 5.4.99.5 90.00%
Proteus mirabilis HI4320 MAGs 1.1.1.25 / 1.3.1.12 / 2.4.2.18 / 2.5.1.19 / 2.5.1.54 / 2.6.1.1 / 2.6.1.42 / 2.6.1.57 / 2.7.1.71 / 4.1.1.48 / 4.1.3.27 / 4.2.1.10 / 4.2.1.20 / 4.2.1.51 / 4.2.3.4 / 4.2.3.5 / 5.3.1.24 / 5.4.99.5 90.00%
Chromobacterium violaceum ATCC 12472 MAGs 1.1.1.25 / 1.3.1.12 / 2.4.2.18 / 2.5.1.19 / 2.5.1.54 / 2.6.1.1 / 2.6.1.42 / 2.6.1.57 / 2.7.1.71 / 4.1.1.48 / 4.1.3.27 / 4.2.1.10 / 4.2.1.20 / 4.2.1.51 / 4.2.3.4 / 4.2.3.5 / 5.3.1.24 / 5.4.99.5 90.00%
Streptococcus pneumoniae TIGR4 MAGs 1.1.1.25 / 1.3.1.12 / 2.4.2.18 / 2.5.1.19 / 2.5.1.54 / 2.6.1.1 / 2.6.1.42 / 2.6.1.57 / 2.7.1.71 / 4.1.1.48 / 4.1.3.27 / 4.2.1.10 / 4.2.1.20 / 4.2.1.51 / 4.2.3.4 / 4.2.3.5 / 5.3.1.24 / 5.4.99.5 90.00%
Sinorhizobium meliloti 1021 MAGs 1.1.1.25 / 1.3.1.12 / 2.4.2.18 / 2.5.1.19 / 2.5.1.54 / 2.6.1.1 / 2.6.1.42 / 2.6.1.57 / 2.7.1.71 / 4.1.1.48 / 4.1.3.27 / 4.2.1.10 / 4.2.1.20 / 4.2.1.51 / 4.2.3.4 / 4.2.3.5 / 5.3.1.24 / 5.4.99.5 90.00%
Lachancea fermentati MAGs 1.1.1.25 / 2.4.2.18 / 2.5.1.19 / 2.5.1.54 / 2.6.1.1 / 2.6.1.42 / 2.6.1.57 / 2.7.1.71 / 4.1.1.48 / 4.1.3.27 / 4.2.1.10 / 4.2.1.20 / 4.2.1.51 / 4.2.3.4 / 4.2.3.5 / 5.3.1.24 / 5.4.99.5 85.00%
Zygosaccharomyces rouxii fungi 1.1.1.25 / 2.4.2.18 / 2.5.1.19 / 2.5.1.54 / 2.6.1.1 / 2.6.1.42 / 2.6.1.57 / 2.7.1.71 / 4.1.1.48 / 4.1.3.27 / 4.2.1.10 / 4.2.1.20 / 4.2.1.51 / 4.2.3.4 / 4.2.3.5 / 5.3.1.24 / 5.4.99.5 85.00%
Streptomyces albogriseolus bacteria 1.1.1.25 / 1.3.1.12 / 2.4.2.18 / 2.5.1.19 / 2.5.1.54 / 2.6.1.1 / 2.6.1.42 / 2.7.1.71 / 4.1.1.48 / 4.1.3.27 / 4.2.1.10 / 4.2.1.20 / 4.2.1.51 / 4.2.3.4 / 4.2.3.5 / 5.3.1.24 / 5.4.99.5 85.00%
Paraburkholderia graminis bacteria 1.1.1.25 / 1.3.1.12 / 2.4.2.18 / 2.5.1.19 / 2.5.1.54 / 2.6.1.42 / 2.6.1.57 / 2.7.1.71 / 4.1.1.48 / 4.1.3.27 / 4.2.1.10 / 4.2.1.20 / 4.2.1.51 / 4.2.3.4 / 4.2.3.5 / 5.3.1.24 / 5.4.99.5 85.00%
Mycobacterium tuberculosis H37Rv MAGs 1.3.1.12 / 2.4.2.18 / 2.5.1.19 / 2.5.1.54 / 2.6.1.1 / 2.6.1.42 / 2.6.1.57 / 2.7.1.71 / 4.1.1.48 / 4.1.3.27 / 4.2.1.10 / 4.2.1.20 / 4.2.1.51 / 4.2.3.4 / 4.2.3.5 / 5.3.1.24 / 5.4.99.5 85.00%