FAQ
Frequently Asked Questions
01
本数据库的付费内容
本数据库的基于所采集的公共数据库中的生物学数据,进行二次加工。结合自身所采集的实验室样本数据进行汇编。大部分信息内容经过人工编辑后对外发布。您只需要进行账号注册登录后,即可通过网页进行数据库内容的浏览。但是假若您需要将本数据库集成到您的软件或者数据分析流程之中, 您会需要付费购买对应的数字授权,方可使用本数据库所提供的api接口进行自动化数据访问,或者下载离线数据库。
02
代码开源
本数据库除数据库数据外,数据库系统以及网站,以及合成菌群设计工具的源代码开放,可以访问Github仓库进行源代码下载:
- 网站源代码:https://github.com/Archenoia/registry
- 数据库编辑器源代码:https://github.com/Archenoia/biocad_registry
- 合成菌群自动化设计工具:https://github.com/Archenoia/GMN-Designer
03
公共数据来源
本数据库的基础数据采集自以下公共数据库:
- 代谢物信息:NCBI PubChem,HMDB,KEGG,ChEBI,Metabolomics Workbench
- 蛋白质信息:UniProt
- 代谢通路信息:Reactome,BioCyc
- 代谢网络信息:Rhea,KEGG,BRENDA,SABIO-rk
04
生成式AI内容申明
部分数据库内容采用了智谱清言(ChatGLM)生成式AI进行自动化处理:补充缺失的化合物分类信息以及化合物描述信息内容。以上生成式AI内容经过AI自动化生成后,再经过人工修订后进行发布。
05
论文引用
建设单位
本数据库由以下单位进行共建
常州正雅生物科技有限公司
中国 常州 武进国家高新技术产业开发区主要负责数据库商业化运营,运营维护
江南大学
江苏 无锡针对数据库内容进行人工修订,提供学术支持
SMRUCC genomics Institution
中国 桂林 临桂区 秧塘工业园区主要负责数据库系统开发,实验室数据采集,以及数据分析