Cysteine Biosynthesis

Metabolites

2-Oxoglutarate

Formula: C5H6O5 (146.0215226)

CAS ID: 328-50-7

3-Phosphonooxypyruvate

Formula: C3H5O7P (183.977291)

CAS ID: 3913-50-6

3'-Phosphoadenylyl sulfate

Formula: C10H15N5O13P2S (506.98623200000003)

CAS ID: 482-67-7

Acetate

Formula: C2H4O2 (60.0211284)

CAS ID: 64-19-7

Acetyl-CoA

Formula: C23H38N7O17P3S (809.1257688000001)

CAS ID: 72-89-9

Adenosine 3',5'-bisphosphate

Formula: C10H15N5O10P2 (427.02941500000003)

CAS ID: 1053-73-2

Adenylyl sulfate

Formula: C10H14N5O10PS (427.01989940000004)

CAS ID: 485-84-7

ADP

Formula: C10H15N5O10P2 (427.02941500000003)

CAS ID: 58-64-0

ATP

Formula: C10H16N5O13P3 (506.9957476)

CAS ID: 56-65-5

Glycerate 3-phosphate

Formula: C3H7O7P (185.9929402)

CAS ID: 820-11-1

H+

Formula: H (1.0078246)

CAS ID: 12408-02-5

H2O

Formula: H2O (18.0105642)

CAS ID: 7732-18-5

L-Cysteine

Formula: C3H7NO2S (121.0197482)

CAS ID: 52-90-4

L-Glutamate

Formula: C5H9NO4 (147.0531554)

CAS ID: 56-86-0

L-Serine

Formula: C3H7NO3 (105.0425912)

CAS ID: 56-45-1

NAD+

Formula: C21H28N7O14P2 (664.1169428000001)

CAS ID: 53-84-9

NADH

Formula: C21H29N7O14P2 (665.1247674)

CAS ID: 58-68-4

NADP+

Formula: C21H29N7O17P3 (744.0832754)

CAS ID: 53-59-8

S-Sulfo-L-cysteine

Formula: C3H7NO5S2 (200.97656519999998)

CAS ID: 1637-71-4

Sulfate

Formula: H2SO4 (97.9673812)

CAS ID: 7664-93-9

diphosphate

Formula: O7P2 (173.911931)

CAS ID: 14000-31-8

phosphate(3-)

Formula: O4P (94.953423)

CAS ID: 14265-44-2

sulfite

Formula: O3S (79.956817)

CAS ID: 14265-45-3

thiosulfate(2-)

Formula: O3S2 (111.928889)

CAS ID: 14383-50-7

O-phosphoserine

Formula: C3H8NO6P (185.0089238)

CAS ID: 17885-08-4



Enzyme

EC Number name full name note
1.1.1.399 2-oxoglutarate reductase (R)-2-hydroxyglutarate,NAD+ 2-oxidireductase
1.1.1.95 phosphoglycerate dehydrogenase 3-phospho-D-glycerate:NAD+ 2-oxidoreductase
1.8.1.2 assimilatory sulfite reductase (NADPH) hydrogen-sulfide:NADP+ oxidoreductase
1.8.4.8 phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin) adenosine 3',5'-bisphosphate,sulfite:thioredoxin-disulfide oxidoreductase (3'-phosphoadenosine-5'-phosphosulfate-forming)
2.3.1.30 serine O-acetyltransferase acetyl-CoA:L-serine O-acetyltransferase
2.5.1.47 cysteine synthase O3-acetyl-L-serine:hydrogen-sulfide 2-amino-2-carboxyethyltransferase
2.6.1.52 phosphoserine transaminase O-phospho-L-serine:2-oxoglutarate aminotransferase
2.7.1.25 adenylyl-sulfate kinase ATP:adenylyl-sulfate 3'-phosphotransferase
2.7.7.4 sulfate adenylyltransferase ATP:sulfate adenylyltransferase
3.1.3.3 phosphoserine phosphatase O-phosphoserine phosphohydrolase
4.5.1.5 S-carboxymethylcysteine synthase 3-chloro-L-alanine chloride-lyase (adding thioglycolate; S-carboxymethyl-L-cysteine-forming)


Pathway Source

Organism Taxonomy Group Enzyme List Source Ratio
Escherichia coli K-12 MAGs 1.1.1.399 / 1.1.1.95 / 1.8.1.2 / 1.8.4.8 / 2.3.1.30 / 2.5.1.47 / 2.6.1.52 / 2.7.1.25 / 2.7.7.4 / 3.1.3.3 / 4.5.1.5 100.00%
Schizosaccharomyces pombe 972h- MAGs 1.1.1.399 / 1.1.1.95 / 1.8.1.2 / 1.8.4.8 / 2.3.1.30 / 2.5.1.47 / 2.6.1.52 / 2.7.1.25 / 2.7.7.4 / 3.1.3.3 90.91%
Escherichia coli O157:H7 MAGs 1.1.1.399 / 1.1.1.95 / 1.8.1.2 / 1.8.4.8 / 2.3.1.30 / 2.5.1.47 / 2.6.1.52 / 2.7.1.25 / 2.7.7.4 / 3.1.3.3 90.91%
Rheinheimera tangshanensis bacteria 1.1.1.399 / 1.1.1.95 / 1.8.1.2 / 1.8.4.8 / 2.3.1.30 / 2.5.1.47 / 2.6.1.52 / 2.7.1.25 / 2.7.7.4 / 3.1.3.3 90.91%
Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168 MAGs 1.1.1.399 / 1.1.1.95 / 1.8.1.2 / 1.8.4.8 / 2.3.1.30 / 2.5.1.47 / 2.6.1.52 / 2.7.1.25 / 2.7.7.4 / 3.1.3.3 90.91%
Torulaspora delbrueckii fungi 1.1.1.399 / 1.1.1.95 / 1.8.1.2 / 1.8.4.8 / 2.5.1.47 / 2.6.1.52 / 2.7.1.25 / 2.7.7.4 / 3.1.3.3 81.82%
Saccharomyces paradoxus fungi 1.1.1.399 / 1.1.1.95 / 1.8.1.2 / 1.8.4.8 / 2.5.1.47 / 2.6.1.52 / 2.7.1.25 / 2.7.7.4 / 3.1.3.3 81.82%
Aspergillus oryzae fungi 1.1.1.399 / 1.1.1.95 / 1.8.1.2 / 1.8.4.8 / 2.5.1.47 / 2.6.1.52 / 2.7.1.25 / 2.7.7.4 / 3.1.3.3 81.82%
Penicillium griseofulvum fungi 1.1.1.399 / 1.1.1.95 / 1.8.1.2 / 1.8.4.8 / 2.5.1.47 / 2.6.1.52 / 2.7.1.25 / 2.7.7.4 / 3.1.3.3 81.82%
Aspergillus parasiticus MAGs 1.1.1.399 / 1.1.1.95 / 1.8.1.2 / 1.8.4.8 / 2.5.1.47 / 2.6.1.52 / 2.7.1.25 / 2.7.7.4 / 3.1.3.3 81.82%
Penicillium canescens fungi 1.1.1.399 / 1.1.1.95 / 1.8.1.2 / 1.8.4.8 / 2.5.1.47 / 2.6.1.52 / 2.7.1.25 / 2.7.7.4 / 3.1.3.3 81.82%
Aspergillus flavus fungi 1.1.1.399 / 1.1.1.95 / 1.8.1.2 / 1.8.4.8 / 2.5.1.47 / 2.6.1.52 / 2.7.1.25 / 2.7.7.4 / 3.1.3.3 81.82%
Penicillium brevicompactum fungi 1.1.1.399 / 1.1.1.95 / 1.8.1.2 / 1.8.4.8 / 2.5.1.47 / 2.6.1.52 / 2.7.1.25 / 2.7.7.4 / 3.1.3.3 81.82%
Shigella flexneri bacteria 1.1.1.399 / 1.1.1.95 / 1.8.1.2 / 1.8.4.8 / 2.3.1.30 / 2.6.1.52 / 2.7.1.25 / 2.7.7.4 / 3.1.3.3 81.82%
Trichophyton rubrum fungi 1.1.1.399 / 1.1.1.95 / 1.8.1.2 / 1.8.4.8 / 2.5.1.47 / 2.6.1.52 / 2.7.1.25 / 2.7.7.4 / 3.1.3.3 81.82%
Aspergillus niger fungi 1.1.1.399 / 1.1.1.95 / 1.8.1.2 / 1.8.4.8 / 2.5.1.47 / 2.6.1.52 / 2.7.1.25 / 2.7.7.4 / 3.1.3.3 81.82%
Penicillium chrysogenum fungi 1.1.1.399 / 1.1.1.95 / 1.8.1.2 / 1.8.4.8 / 2.5.1.47 / 2.6.1.52 / 2.7.1.25 / 2.7.7.4 / 3.1.3.3 81.82%
Zygosaccharomyces rouxii fungi 1.1.1.399 / 1.1.1.95 / 1.8.1.2 / 1.8.4.8 / 2.5.1.47 / 2.6.1.52 / 2.7.1.25 / 2.7.7.4 / 3.1.3.3 81.82%
Nakaseomyces glabratus fungi 1.1.1.399 / 1.1.1.95 / 1.8.1.2 / 1.8.4.8 / 2.5.1.47 / 2.6.1.52 / 2.7.1.25 / 2.7.7.4 / 3.1.3.3 81.82%
Lachancea fermentati MAGs 1.1.1.399 / 1.1.1.95 / 1.8.1.2 / 1.8.4.8 / 2.5.1.47 / 2.6.1.52 / 2.7.1.25 / 2.7.7.4 / 3.1.3.3 81.82%