Arginine Metabolism
Metabolites
Enzyme
| EC Number | name | full name | note |
|---|---|---|---|
| 1.2.1.- | |||
| 1.2.1.16 | succinate-semialdehyde dehydrogenase [NAD(P)+] | succinate-semialdehyde:NAD(P)+ oxidoreductase | |
| 1.2.1.19 | aminobutyraldehyde dehydrogenase | 4-aminobutanal:NAD+ 1-oxidoreductase | |
| 1.2.1.38 | N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase | N-acetyl-L-glutamate-5-semialdehyde:NADP+ 5-oxidoreductase (phosphorylating) | |
| 1.2.1.5 | aldehyde dehydrogenase [NAD(P)+] | aldehyde:NAD(P)+ oxidoreductase | |
| 1.2.1.71 | succinylglutamate-semialdehyde dehydrogenase | N-succinyl-L-glutamate 5-semialdehyde:NAD+ oxidoreductase | |
| 1.2.1.79 | succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+) | succinate-semialdehyde:NADP+ oxidoreductase | |
| 2.1.3.3 | ornithine carbamoyltransferase | carbamoyl-phosphate:L-ornithine carbamoyltransferase | |
| 2.3.1.109 | arginine N-succinyltransferase | succinyl-CoA:L-arginine N2-succinyltransferase | |
| 2.6.1.11 | acetylornithine transaminase | N2-acetyl-L-ornithine:2-oxoglutarate 5-aminotransferase | |
| 2.6.1.17 | succinyldiaminopimelate transaminase | N-succinyl-L-2,6-diaminoheptanedioate:2-oxoglutarate aminotransferase | |
| 2.6.1.19 | 4-aminobutyrate-2-oxoglutarate transaminase | 4-aminobutanoate:2-oxoglutarate aminotransferase | |
| 2.6.1.29 | diamine transaminase | diamine:2-oxoglutarate aminotransferase | |
| 2.6.1.48 | 5-aminovalerate transaminase | 5-aminopentanoate:2-oxoglutarate aminotransferase | |
| 2.6.1.81 | succinylornithine transaminase | N2-succinyl-L-ornithine:2-oxoglutarate 5-aminotransferase | |
| 2.6.1.82 | putrescine-2-oxoglutarate transaminase | putrescine:2-oxoglutarate aminotransferase | |
| 2.7.2.8 | acetylglutamate kinase | ATP:N-acetyl-L-glutamate 5-phosphotransferase | |
| 3.5.1.16 | acetylornithine deacetylase | N2-acetyl-L-ornithine amidohydrolase | |
| 3.5.1.94 | gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase | 4-(glutamylamino)butanoate amidohydrolase | |
| 3.5.1.96 | succinylglutamate desuccinylase | N-succinyl-L-glutamate amidohydrolase | |
| 3.5.3.11 | agmatinase | agmatine amidinohydrolase | |
| 3.5.3.23 | N-succinylarginine dihydrolase | N2-succinyl-L-arginine iminohydrolase (decarboxylating) | |
| 4.1.1.19 | arginine decarboxylase | L-arginine carboxy-lyase (agmatine-forming) | |
| 4.3.2.1 | argininosuccinate lyase | 2-(Nomega-L-arginino)succinate arginine-lyase (fumarate-forming) | |
| 6.3.1.11 | glutamate-putrescine ligase | L-glutamate:putrescine ligase (ADP-forming) | |
| 6.3.4.16 | carbamoyl-phosphate synthase (ammonia) | carbon-dioxide:ammonia ligase (ADP-forming, carbamate-phosphorylating) | |
| 6.3.4.5 | argininosuccinate synthase | L-citrulline:L-aspartate ligase (AMP-forming) | |
| 6.3.5.5 | carbamoyl-phosphate synthase (glutamine-hydrolysing) | hydrogen-carbonate:L-glutamine amido-ligase (ADP-forming, carbamate-phosphorylating) |
Pathway Source
| Organism | Taxonomy Group | Enzyme List | Source Ratio |
|---|---|---|---|
| Escherichia coli K-12 | MAGs | 1.2.1.- / 1.2.1.16 / 1.2.1.19 / 1.2.1.38 / 1.2.1.5 / 1.2.1.71 / 1.2.1.79 / 2.1.3.3 / 2.3.1.109 / 2.6.1.11 / 2.6.1.17 / 2.6.1.19 / 2.6.1.29 / 2.6.1.48 / 2.6.1.81 / 2.6.1.82 / 2.7.2.8 / 3.5.1.16 / 3.5.1.94 / 3.5.1.96 / 3.5.3.11 / 3.5.3.23 / 4.1.1.19 / 4.3.2.1 / 6.3.1.11 / 6.3.4.16 / 6.3.4.5 / 6.3.5.5 | 100.00% |
| Pseudomonas putida KT2440 | MAGs | 1.2.1.- / 1.2.1.19 / 1.2.1.38 / 1.2.1.71 / 1.2.1.79 / 2.1.3.3 / 2.3.1.109 / 2.6.1.11 / 2.6.1.17 / 2.6.1.19 / 2.6.1.48 / 2.6.1.81 / 2.7.2.8 / 3.5.1.16 / 3.5.1.94 / 3.5.1.96 / 3.5.3.11 / 3.5.3.23 / 4.1.1.19 / 4.3.2.1 / 6.3.1.11 / 6.3.4.16 / 6.3.4.5 / 6.3.5.5 | 85.71% |
| Escherichia coli O157:H7 | MAGs | 1.2.1.- / 1.2.1.19 / 1.2.1.38 / 1.2.1.71 / 2.1.3.3 / 2.3.1.109 / 2.6.1.11 / 2.6.1.17 / 2.6.1.29 / 2.6.1.81 / 2.6.1.82 / 2.7.2.8 / 3.5.1.16 / 3.5.1.94 / 3.5.1.96 / 3.5.3.11 / 3.5.3.23 / 4.1.1.19 / 4.3.2.1 / 6.3.4.16 / 6.3.4.5 / 6.3.5.5 | 78.57% |
| Escherichia coli CFT073 | MAGs | 1.2.1.- / 1.2.1.19 / 1.2.1.38 / 1.2.1.71 / 2.1.3.3 / 2.3.1.109 / 2.6.1.11 / 2.6.1.17 / 2.6.1.29 / 2.6.1.81 / 2.6.1.82 / 2.7.2.8 / 3.5.1.16 / 3.5.1.96 / 3.5.3.11 / 3.5.3.23 / 4.1.1.19 / 4.3.2.1 / 6.3.4.16 / 6.3.4.5 / 6.3.5.5 | 75.00% |
| Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2 | MAGs | 1.2.1.- / 1.2.1.19 / 1.2.1.38 / 1.2.1.71 / 2.1.3.3 / 2.3.1.109 / 2.6.1.11 / 2.6.1.17 / 2.6.1.29 / 2.6.1.81 / 2.6.1.82 / 2.7.2.8 / 3.5.1.16 / 3.5.1.96 / 3.5.3.11 / 3.5.3.23 / 4.1.1.19 / 4.3.2.1 / 6.3.4.16 / 6.3.4.5 / 6.3.5.5 | 75.00% |
| Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi | MAGs | 1.2.1.- / 1.2.1.19 / 1.2.1.38 / 1.2.1.71 / 2.1.3.3 / 2.3.1.109 / 2.6.1.11 / 2.6.1.17 / 2.6.1.29 / 2.6.1.81 / 2.6.1.82 / 2.7.2.8 / 3.5.1.16 / 3.5.1.96 / 3.5.3.11 / 3.5.3.23 / 4.1.1.19 / 4.3.2.1 / 6.3.4.16 / 6.3.4.5 / 6.3.5.5 | 75.00% |
| Shigella flexneri | bacteria | 1.2.1.- / 1.2.1.19 / 1.2.1.38 / 1.2.1.71 / 2.1.3.3 / 2.3.1.109 / 2.6.1.11 / 2.6.1.17 / 2.6.1.29 / 2.6.1.82 / 2.7.2.8 / 3.5.1.16 / 3.5.1.94 / 3.5.1.96 / 3.5.3.11 / 4.1.1.19 / 4.3.2.1 / 6.3.4.16 / 6.3.4.5 / 6.3.5.5 | 71.43% |
| Pseudomonas aeruginosa PAO1 | MAGs | 1.2.1.- / 1.2.1.38 / 1.2.1.71 / 2.1.3.3 / 2.3.1.109 / 2.6.1.11 / 2.6.1.17 / 2.6.1.19 / 2.6.1.48 / 2.6.1.81 / 2.7.2.8 / 3.5.1.16 / 3.5.1.96 / 3.5.3.11 / 3.5.3.23 / 4.1.1.19 / 4.3.2.1 / 6.3.4.16 / 6.3.4.5 / 6.3.5.5 | 71.43% |
| Shewanella piezotolerans WP3 | MAGs | 1.2.1.16 / 1.2.1.19 / 1.2.1.38 / 1.2.1.71 / 2.1.3.3 / 2.3.1.109 / 2.6.1.11 / 2.6.1.17 / 2.6.1.19 / 2.7.2.8 / 3.5.1.16 / 3.5.1.96 / 3.5.3.11 / 3.5.3.23 / 4.1.1.19 / 4.3.2.1 / 6.3.4.16 / 6.3.4.5 / 6.3.5.5 | 67.86% |
| Paraburkholderia graminis | bacteria | 1.2.1.- / 1.2.1.16 / 1.2.1.38 / 1.2.1.71 / 1.2.1.79 / 2.1.3.3 / 2.3.1.109 / 2.6.1.11 / 2.6.1.17 / 2.6.1.19 / 2.7.2.8 / 3.5.1.16 / 3.5.1.94 / 3.5.1.96 / 3.5.3.23 / 4.1.1.19 / 4.3.2.1 / 6.3.4.5 / 6.3.5.5 | 67.86% |
| Pseudomonas kairouanensis | bacteria | 1.2.1.- / 1.2.1.38 / 1.2.1.71 / 2.1.3.3 / 2.3.1.109 / 2.6.1.11 / 2.6.1.17 / 2.6.1.19 / 2.6.1.48 / 2.7.2.8 / 3.5.1.16 / 3.5.1.96 / 3.5.3.11 / 3.5.3.23 / 4.1.1.19 / 4.3.2.1 / 6.3.4.16 / 6.3.4.5 / 6.3.5.5 | 67.86% |
| Pseudomonas syringae pv. syringae | MAGs | 1.2.1.- / 1.2.1.38 / 1.2.1.71 / 2.1.3.3 / 2.3.1.109 / 2.6.1.11 / 2.6.1.17 / 2.6.1.19 / 2.7.2.8 / 3.5.1.16 / 3.5.1.94 / 3.5.1.96 / 3.5.3.23 / 4.1.1.19 / 4.3.2.1 / 6.3.4.16 / 6.3.4.5 / 6.3.5.5 | 64.29% |
| Pseudomonas nabeulensis | bacteria | 1.2.1.- / 1.2.1.38 / 1.2.1.71 / 2.1.3.3 / 2.3.1.109 / 2.6.1.11 / 2.6.1.17 / 2.6.1.48 / 2.7.2.8 / 3.5.1.16 / 3.5.1.96 / 3.5.3.11 / 3.5.3.23 / 4.1.1.19 / 4.3.2.1 / 6.3.4.16 / 6.3.4.5 / 6.3.5.5 | 64.29% |
| Chromobacterium violaceum ATCC 12472 | MAGs | 1.2.1.- / 1.2.1.16 / 1.2.1.38 / 1.2.1.71 / 2.1.3.3 / 2.3.1.109 / 2.6.1.11 / 2.6.1.17 / 2.6.1.19 / 2.7.2.8 / 3.5.1.16 / 3.5.1.96 / 3.5.3.11 / 3.5.3.23 / 4.1.1.19 / 4.3.2.1 / 6.3.4.5 / 6.3.5.5 | 64.29% |
| Burkholderia pseudomallei K96243 | MAGs | 1.2.1.- / 1.2.1.16 / 1.2.1.19 / 1.2.1.38 / 1.2.1.71 / 2.1.3.3 / 2.3.1.109 / 2.6.1.17 / 2.6.1.19 / 2.6.1.81 / 2.7.2.8 / 3.5.1.16 / 3.5.1.96 / 3.5.3.11 / 3.5.3.23 / 4.3.2.1 / 6.3.4.5 / 6.3.5.5 | 64.29% |
| Enterobacter sp. 638 | bacteria | 1.2.1.- / 1.2.1.16 / 1.2.1.19 / 1.2.1.38 / 1.2.1.71 / 2.1.3.3 / 2.3.1.109 / 2.6.1.17 / 2.6.1.19 / 2.6.1.29 / 2.6.1.82 / 2.7.2.8 / 3.5.1.16 / 3.5.3.11 / 3.5.3.23 / 4.3.2.1 / 6.3.4.5 | 60.71% |
| Paraburkholderia bengalensis | bacteria | 1.2.1.- / 1.2.1.38 / 1.2.1.71 / 2.1.3.3 / 2.3.1.109 / 2.6.1.11 / 2.6.1.17 / 2.6.1.19 / 2.7.2.8 / 3.5.1.16 / 3.5.1.96 / 3.5.3.11 / 3.5.3.23 / 4.1.1.19 / 4.3.2.1 / 6.3.4.5 / 6.3.5.5 | 60.71% |
| Erwinia amylovora ATCC 49946 | MAGs | 1.2.1.38 / 1.2.1.71 / 2.1.3.3 / 2.3.1.109 / 2.6.1.11 / 2.6.1.17 / 2.6.1.19 / 2.6.1.81 / 2.7.2.8 / 3.5.1.16 / 3.5.1.96 / 3.5.3.11 / 3.5.3.23 / 4.1.1.19 / 4.3.2.1 / 6.3.4.5 / 6.3.5.5 | 60.71% |
| Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168 | MAGs | 1.2.1.- / 1.2.1.16 / 1.2.1.38 / 1.2.1.5 / 1.2.1.79 / 2.1.3.3 / 2.6.1.11 / 2.6.1.19 / 2.6.1.48 / 2.7.2.8 / 3.5.1.16 / 3.5.3.11 / 4.1.1.19 / 4.3.2.1 / 6.3.4.16 / 6.3.4.5 / 6.3.5.5 | 60.71% |
| Bacillus cereus ATCC 14579 | MAGs | 1.2.1.- / 1.2.1.16 / 1.2.1.38 / 1.2.1.5 / 1.2.1.79 / 2.1.3.3 / 2.6.1.11 / 2.6.1.19 / 2.7.2.8 / 3.5.1.16 / 3.5.3.11 / 4.1.1.19 / 4.3.2.1 / 6.3.4.16 / 6.3.4.5 / 6.3.5.5 | 57.14% |