Aspartate Metabolism

Metabolites

2-Oxoglutarate

Formula: C5H6O5 (146.0215226)

CAS ID: 328-50-7

Ammonia

Formula: NH3 (17.0265478)

CAS ID: 7664-41-7

AMP

Formula: C10H14N5O7P (347.06308240000004)

CAS ID: 61-19-8

ATP

Formula: C10H16N5O13P3 (506.9957476)

CAS ID: 56-65-5

GDP

Formula: C10H15N5O11P2 (443.02433)

CAS ID: 146-91-8

GTP

Formula: C10H16N5O14P3 (522.9906626)

CAS ID: 86-01-1

H2O

Formula: H2O (18.0105642)

CAS ID: 7732-18-5

Hydrogen peroxide

Formula: H2O2 (34.0054792)

CAS ID: 7722-84-1

IMP

Formula: C10H13N4O8P (348.0470988)

CAS ID: 131-99-7

L-Asparagine

Formula: C4H8N2O3 (132.05348980000002)

CAS ID: 70-47-3

L-Glutamate

Formula: C5H9NO4 (147.0531554)

CAS ID: 56-86-0

L-Glutamine

Formula: C5H10N2O3 (146.069139)

CAS ID: 56-85-9

Oxaloacetate

Formula: C4H4O5 (132.00587339999998)

CAS ID: 328-42-7

Oxygen

Formula: O2 (31.98983)

CAS ID: 7782-44-7

diphosphate

Formula: O7P2 (173.911931)

CAS ID: 14000-31-8

phosphate(3-)

Formula: O4P (94.953423)

CAS ID: 14265-44-2



Enzyme

EC Number name full name note
1.5.99.-
1.4.3.16 L-aspartate oxidase L-aspartate:oxygen oxidoreductase
2.1.3.2 aspartate carbamoyltransferase carbamoyl-phosphate:L-aspartate carbamoyltransferase
2.6.1.1 aspartate transaminase L-aspartate:2-oxoglutarate aminotransferase
4.3.1.1 aspartate ammonia-lyase L-aspartate ammonia-lyase (fumarate-forming)
4.3.2.1 argininosuccinate lyase 2-(Nomega-L-arginino)succinate arginine-lyase (fumarate-forming)
4.3.2.2 adenylosuccinate lyase N6-(1,2-dicarboxyethyl)AMP AMP-lyase (fumarate-forming)
6.3.1.1 aspartate-ammonia ligase L-aspartate:ammonia ligase (AMP-forming)
6.3.4.4 adenylosuccinate synthase IMP:L-aspartate ligase (GDP-forming)
6.3.4.5 argininosuccinate synthase L-citrulline:L-aspartate ligase (AMP-forming)
6.3.5.4 asparagine synthase (glutamine-hydrolysing) L-aspartate:L-glutamine amido-ligase (AMP-forming)


Pathway Source

Organism Taxonomy Group Enzyme List Source Ratio
Escherichia coli K-12 MAGs 1.4.3.16 / 1.5.99.- / 2.1.3.2 / 2.6.1.1 / 4.3.1.1 / 4.3.2.1 / 4.3.2.2 / 6.3.1.1 / 6.3.4.4 / 6.3.4.5 / 6.3.5.4 100.00%
Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168 MAGs 1.4.3.16 / 1.5.99.- / 2.1.3.2 / 2.6.1.1 / 4.3.1.1 / 4.3.2.1 / 4.3.2.2 / 6.3.4.4 / 6.3.4.5 / 6.3.5.4 90.91%
Bacteroides fragilis NCTC 9343 MAGs 1.4.3.16 / 2.1.3.2 / 2.6.1.1 / 4.3.1.1 / 4.3.2.1 / 4.3.2.2 / 6.3.1.1 / 6.3.4.4 / 6.3.4.5 / 6.3.5.4 90.91%
Bacillus cereus ATCC 14579 MAGs 1.4.3.16 / 2.1.3.2 / 2.6.1.1 / 4.3.1.1 / 4.3.2.1 / 4.3.2.2 / 6.3.1.1 / 6.3.4.4 / 6.3.4.5 / 6.3.5.4 90.91%
Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966 MAGs 1.4.3.16 / 2.1.3.2 / 2.6.1.1 / 4.3.1.1 / 4.3.2.1 / 4.3.2.2 / 6.3.1.1 / 6.3.4.4 / 6.3.4.5 / 6.3.5.4 90.91%
Vibrio vulnificus CMCP6 MAGs 1.4.3.16 / 2.1.3.2 / 2.6.1.1 / 4.3.1.1 / 4.3.2.1 / 4.3.2.2 / 6.3.4.4 / 6.3.4.5 / 6.3.5.4 81.82%
Rhodococcus opacus B4 MAGs 1.4.3.16 / 2.1.3.2 / 2.6.1.1 / 4.3.1.1 / 4.3.2.1 / 4.3.2.2 / 6.3.4.4 / 6.3.4.5 / 6.3.5.4 81.82%
Haloferax volcanii DS2 MAGs 1.4.3.16 / 1.5.99.- / 2.1.3.2 / 2.6.1.1 / 4.3.2.1 / 4.3.2.2 / 6.3.4.4 / 6.3.4.5 / 6.3.5.4 81.82%
Colwellia psychrerythraea 34H MAGs 1.4.3.16 / 2.1.3.2 / 2.6.1.1 / 4.3.1.1 / 4.3.2.1 / 4.3.2.2 / 6.3.4.4 / 6.3.4.5 / 6.3.5.4 81.82%
Natrialba magadii ATCC 43099 MAGs 1.4.3.16 / 1.5.99.- / 2.1.3.2 / 2.6.1.1 / 4.3.2.1 / 4.3.2.2 / 6.3.4.4 / 6.3.4.5 / 6.3.5.4 81.82%
Clostridium butyricum 5521 MAGs 1.4.3.16 / 2.1.3.2 / 2.6.1.1 / 4.3.1.1 / 4.3.2.1 / 4.3.2.2 / 6.3.1.1 / 6.3.4.5 / 6.3.5.4 81.82%
Pseudomonas putida KT2440 MAGs 1.4.3.16 / 2.1.3.2 / 2.6.1.1 / 4.3.1.1 / 4.3.2.1 / 4.3.2.2 / 6.3.4.4 / 6.3.4.5 / 6.3.5.4 81.82%
Pseudomonas aeruginosa PAO1 MAGs 1.4.3.16 / 2.1.3.2 / 2.6.1.1 / 4.3.1.1 / 4.3.2.1 / 4.3.2.2 / 6.3.4.4 / 6.3.4.5 / 6.3.5.4 81.82%
Streptomyces albogriseolus bacteria 1.4.3.16 / 1.5.99.- / 2.1.3.2 / 2.6.1.1 / 4.3.2.1 / 4.3.2.2 / 6.3.4.4 / 6.3.4.5 / 6.3.5.4 81.82%
Azospirillum sp. B510 bacteria 1.4.3.16 / 2.1.3.2 / 2.6.1.1 / 4.3.1.1 / 4.3.2.1 / 4.3.2.2 / 6.3.4.4 / 6.3.4.5 / 6.3.5.4 81.82%
Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida MAGs 1.4.3.16 / 2.1.3.2 / 4.3.1.1 / 4.3.2.1 / 4.3.2.2 / 6.3.1.1 / 6.3.4.4 / 6.3.4.5 / 6.3.5.4 81.82%
Cupriavidus taiwanensis bacteria 1.4.3.16 / 2.1.3.2 / 2.6.1.1 / 4.3.1.1 / 4.3.2.1 / 4.3.2.2 / 6.3.4.4 / 6.3.4.5 / 6.3.5.4 81.82%
Saccharopolyspora erythraea NRRL 2338 MAGs 1.4.3.16 / 2.1.3.2 / 2.6.1.1 / 4.3.1.1 / 4.3.2.1 / 4.3.2.2 / 6.3.4.4 / 6.3.4.5 / 6.3.5.4 81.82%
Chromobacterium violaceum ATCC 12472 MAGs 1.4.3.16 / 2.1.3.2 / 2.6.1.1 / 4.3.1.1 / 4.3.2.1 / 4.3.2.2 / 6.3.4.4 / 6.3.4.5 / 6.3.5.4 81.82%
Clostridium kluyveri DSM 555 MAGs 1.4.3.16 / 2.1.3.2 / 2.6.1.1 / 4.3.1.1 / 4.3.2.1 / 4.3.2.2 / 6.3.4.4 / 6.3.4.5 / 6.3.5.4 81.82%